| KV-Id | Scheme | Chromosome | FISH Location | Maximum Cytological Range | GenBank Scaffold Id | WGS3 Scaffold Id | Scaffold Size | Insertion Site | Closest Gene | Distance from Closest Gene | Problematic? | Notes |
| KV0039 | 5 | (44-45) | AABU01000117 | 211000022278147 | <50000 | 16456 | ||||||
| KV0058 | 5 | 2 | 44-45 | (44-45) | AABU01000117 | 211000022278147 | <50000 | 16456 | ||||
| KV0341 | 5 | AABU01000154 | 211000022278184 | <50000 | 862 | |||||||
| KV0410 | 5 | X^Y | AABU01000154 | 211000022278184 | <50000 | 862 | ||||||
| KV0522 | 5 | Y | 11--13 | (11-13) | AABU01000509 | 211000022278539 | <50000 | 259 | ||||
| KV0346 | 3 | Y | AABU01000528 | 211000022278558 | <50000 | 806 | ||||||
| KV0708 | AABU01000637 | 211000022278667 | <50000 | 467 | ||||||||
| KV0547 | 1 | X | AABU01000850 | 211000022278880 | <50000 | 524 | ||||||
| KV0404 | 3 | Y | AABU01000989 | 211000022279019 | <50000 | 149 | ||||||
| KV0590 | 5 | Y | AABU01001156 | 211000022279186 | <50000 | 892 | ||||||
| KV0308 | 1 | Y | AABU01001422 | 211000022279452 | <50000 | 616 | ||||||
| KV0379 | 9 | Y | (38-41) | AABU01001650 | 211000022279680 | <50000 | 1055 | YES | 3' of gene | |||
| KV0356 | 5 | Y | (38-41) | AABU01001846 | 211000022279876 | <50000 | 1137 | YES | ||||
| KV0496 | 1 | Y | (38-41) | AABU01001846 | 211000022279876 | <50000 | 1137 | YES | ||||
| KV0503 | 5 | 2 | 38-41 | (38-41) | AABU01001846 | 211000022279876 | <50000 | 1137 | YES | |||
| KV0379 | 9 | Y | (38-41) | AABU01001846 | 211000022279876 | <50000 | 1133 | YES | 5' of gene | |||
| KV0210 | 5 | AABU01001944 | 211000022279974 | <50000 | 475 | |||||||
| KV0337 | 1 | (38-41) | AABU01001947 | 211000022279977 | 252008 | 54606 | CG12552 | 884 | ||||
| KV0065 | 5 | 2 | 39 | (38-41) | AABU01001947 | 211000022279977 | 252008 | 83612 | CG12552 | -28557 | ||
| KV0066 | 5 | 2 | 38 | (38-41) | AABU01001947 | 211000022279977 | 252008 | 83612 | CG12552 | -28557 | ||
| KV0067 | 5 | 2 | 42 | (38-41) | AABU01001947 | 211000022279977 | 252008 | 83613 | CG12552 | -28558 | ||
| KV0139 | P | 2 | 39-41 | (38-41) | AABU01001947 | 211000022279977 | 252008 | 83862 | CG12552 | -28299 | ||
| KV0176 | 1 | 2 | 37-38 | (38-41) | AABU01001947 | 211000022279977 | 252008 | 108583 | CG40239 | 11427 | ||
| KV0445 | 3 | 2 | 39-41 | (38-41) | AABU01001947 | 211000022279977 | 252008 | 108583 | CG40239 | 11430 | ||
| KV0698 | 9 | (38-41) | AABU01001947 | 211000022279977 | 252008 | 111229 | CG40239 | 8704 | ||||
| KV0218 | 5 | (38-41) | AABU01001947 | 211000022279977 | 252008 | 142130 | CG40239 | -22197 | ||||
| KV0400 | 1 | 2 | (38-41) | AABU01001947 | 211000022279977 | 252008 | 195991 | CG12559 | 4817 | |||
| KV0025 | 5 | Y | 13 | (13) | AABU01001996 | 211000022280026 | <50000 | 704 | ||||
| KV0592 | 3 | Y | (13) | AABU01001996 | 211000022280026 | <50000 | 781 | |||||
| KV0440 | 5 | 2 | 39-41 | (39-42) | AABU01002199 | 211000022280229 | 160180 | 43551 | CG40219 | -5115 | ||
| KV0158 | P | 2 | 39-41 | (39-42) | AABU01002199 | 211000022280229 | 160180 | 51267 | CG40219 | -5884 | ||
| KV0299 | 6 | 2 | 43-44 | (39-42) | AABU01002199 | 211000022280229 | 160180 | 59967 | CG40334 | 885 | ||
| KV0249 | 7 | (39-42) | AABU01002199 | 211000022280229 | 160180 | 63441 | CG40334 | -2589 | ||||
| KV0376 | 3 | (39-42) | AABU01002199 | 211000022280229 | 160180 | 105731 | CG40220 | 15509 | ||||
| KV0060 | 5 | 2 | (39-42) | AABU01002199 | 211000022280229 | 160180 | 154897 | CG40214 | -23096 | |||
| KV0628 | 9 | Y | 10-11 | (10-11) | AABU01002422 | 211000022280452 | 74602 | 19333 | CG40207 | -34570 | ||
| KV0564 | 3 | Y | (10-11) | AABU01002422 | 211000022280452 | 74602 | 72002 | CG40207 | -55701 | |||
| KV0103 | P | Y | 14 | AABU01002441 | 211000022280471 | <50000 | 1583 | |||||
| KV0264 | (11--13) | AABU01002458 | 211000022280488 | <50000 | 1994 | |||||||
| KV0517 | 5 | Y | 11--13 | (11--13) | AABU01002458 | 211000022280488 | <50000 | 2001 | ||||
| KV0654 | 2 | X^Y | (11--13) | AABU01002458 | 211000022280488 | <50000 | 2177 | |||||
| KV0178 | 1 | AABU01002501 | 211000022280531 | <50000 | 9079 | |||||||
| KV0649 | 1 | (59-61) | AABU01002543 | 211000022280573 | 58601 | 11960 | CG40196 | 7037 | ||||
| KV0435 | 5 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 1635 | CG40190 | -13895 | ||||
| KV0130 | P | 2 | 38-41 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 43336 | CG40192 | 7196 | ||
| KV0135 | P | 2 | 39-41 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 49009 | CG40192 | 7479 | ||
| KV0075 | 6 | 2 | 38-39 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 49017 | CG40192 | 7477 | ||
| KV0052 | 5 | 2 | 38 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 52300 | CG40192 | 5176 | ||
| KV0187 | 1 | 2 | 45 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 52470 | CG40192 | 5461 | ||
| KV0109 | P | 2 | 42-43 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 53210 | CG40192 | 4709 | ||
| KV0127 | P | 2 | 39-41 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 53210 | CG40192 | 4567 | ||
| KV0159 | P | 2 | 39-41 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 53210 | CG40192 | 4565 | ||
| KV0097 | P | 2 | 38 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 53282 | CG40192 | 4589 | ||
| KV0675 | 7 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 68154 | CG40192 | -10677 | ||||
| KV0524 | 3 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 84429 | CG40191 | 3642 | ||||
| KV0500 | 5 | 2 | 39-41 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 85216 | CG40191 | 2854 | ||
| KV0004 | 5 | 2 | 40-41 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 88185 | CG40191 | -57 | ||
| KV0528 | 3 | 2 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 117115 | CG40191 | -28980 | |||
| KV0183 | 1 | (38-41) | AABU01002549 | 211000022280579 | 120373 | 70177 | CG40192 | -12612 | 5' of gene | |||
| KV0427 | 5 | AABU01002571 | 211000022280601 | <50000 | 1572 | |||||||
| KV0348 | 5 | AABU01002634 | 211000022280664 | 151845 | 79460 | CG40182 | 6267 | |||||
| KV0112 | P | 3 | 49 | (47-49) | AABU01002679 | 211000022280709 | 104610 | 28935 | CG40178 | -19576 | ||
| KV0147 | P | 3 | 47 | (47-49) | AABU01002679 | 211000022280709 | 104610 | 31974 | CG40178 | -19804 | ||
| KV0029 | 5 | 3 | 56 | AABU01002691 | 211000022280721 | 151240 | 133363 | CG40159 | -9556 | |||
| KV0497 | 5 | 3 | 58 | AABU01002746 | 211000022280776 | 266001 | 93979 | CG40092 | -6029 | YES | ||
| KV0090 | P | 2 | 39-41 | AABU01002746 | 211000022280776 | 266001 | 111027 | CG40092 | -22995 | YES | ||
| KV0123 | P | 3 | 48 | AABU01002746 | 211000022280776 | 266001 | 145240 | CG40096 | 6939 | YES | ||
| KV0734 | 3 | AABU01002746 | 211000022280776 | 266001 | 148998 | CG40096 | 3181 | YES | ||||
| KV0384 | 3 | AABU01002748 | 211000022280778 | 134094 | 93857 | CG40080 | 34 | |||||
| KV0431 | 9 | (47) | AABU01002753 | 211000022280783 | 50360 | 13536 | CG40064 | -35542 | ||||
| KV0048 | 5 | 3 | 47 | (47) | AABU01002753 | 211000022280783 | 50360 | 50291 | CG40064 | -35618 | ||
| KV0146 | P | 3 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 489566 | CG40050 | -3243 | |||
| KV0486 | 3 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 630214 | CG40057 | 58097 | ||||
| KV0372 | 9 | 3 | 47 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 630520 | CG40057 | 57791 | ||
| KV0148 | P | 3 | 48 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 630524 | CG40057 | 58308 | ||
| KV0076 | 6 | 3 | 47 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 661614 | CG40057 | 26795 | ||
| KV0086 | P | 3 | 47 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 661725 | CG40057 | 26586 | ||
| KV0520 | 5 | 3 | 48 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 661769 | CG40057 | 26542 | ||
| KV0175 | P | 3 | 47 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 661776 | CG40057 | 26828 | ||
| KV0165 | P | 3 | 47-48 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 661793 | CG40057 | 26518 | ||
| KV0453 | 3 | 3 | 47 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 661824 | CG40057 | 26647 | ||
| KV0099 | P | 3 | 48 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 661865 | CG40057 | 26782 | ||
| KV0062 | 5 | 3 | 47-48 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 661877 | CG40057 | 26434 | ||
| KV0366 | 9 | 3 | 47 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 662315 | CG40057 | 25996 | ||
| KV0087 | P | 3 | 49-51 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 665507 | CG40057 | 23347 | ||
| KV0506 | 5 | 3 | 48 | (47-48) | AABU01002755 | 211000022280785 | 712331 | 693093 | CG40400 | 506 | ||
| KV0680 | 3 | AABU01002756 | 211000022280786 | 199613 | 23360 | CG12567 | -26507 | |||||
| KV0003 | 5 | 3 | 49 | (49-52) | AABU01002758 | 211000022280788 | <50000 | 5482 | ||||
| KV0005 | 5 | 3 | 51-52 | (49-52) | AABU01002758 | 211000022280788 | <50000 | 5484 | ||||
| KV0521 | 5 | (49-52) | AABU01002758 | 211000022280788 | <50000 | 17688 | ||||||
| KV0353 | 3 | (44) | AABU01002760 | 211000022280790 | 423813 | 287075 | CG40032 | -5753 | ||||
| KV0549 | 3 | (44) | AABU01002760 | 211000022280790 | 423813 | 287075 | CG40032 | -5710 | ||||
| KV0171 | P | 2 | 44 | (44) | AABU01002760 | 211000022280790 | 423813 | 359603 | CG40409 | 43567 | ||
| KV0428 | 5 | (44) | AABU01002760 | 211000022280790 | 423813 | 411463 | CG40409 | -8484 | ||||
| KV0254 | 7 | 3 | 58 | (58) | AABU01002763 | 211000022280793 | 336328 | 299125 | CG40451 | -54358 | ||
| KV0007 | 5 | 3 | 58 | (58) | AABU01002763 | 211000022280793 | 336328 | 322805 | CG40451 | -78038 | ||
| KV0070 | 5 | 3 | 58 | (58) | AABU01002763 | 211000022280793 | 336328 | 322805 | CG40451 | -78038 | ||
| KV0446 | 5 | 3 | (48-50) | AABU01002764 | 211000022280794 | 466328 | 276800 | CG40412 | 10500 | YES | ||
| KV0154 | P | 3 | 48-49 | (48-50) | AABU01002764 | 211000022280794 | 466328 | 277239 | CG40412 | 10507 | ||
| KV0169 | P | 3 | 49 | (48-50) | AABU01002764 | 211000022280794 | 466328 | 277239 | CG40412 | 10507 | ||
| KV0256 | 7 | 3 | 50 | (48-50) | AABU01002764 | 211000022280794 | 466328 | 296627 | CG40412 | -9455 | ||
| KV0100 | P | 3 | 48 | (48-50) | AABU01002764 | 211000022280794 | 466328 | 296849 | CG40412 | -9220 | ||
| KV0211 | 5 | (48-50) | AABU01002764 | 211000022280794 | 466328 | 308445 | CG40412 | -20814 | ||||
| KV0026 | 5 | 3 | 47 | (48-50) | AABU01002764 | 211000022280794 | 466328 | 458835 | ||||
| KV0462 | 6 | 2 | 45 | AABU01002768 | 211000022280798 | 593945 | 265952 | CG17715 | -4528 | YES | ||
| KV0138 | P | 2 | 36 | (35-36) | AABU01002768 | 211000022280798 | 593945 | 524588 | CG17494 | -8815 | YES | |
| KV0080 | 6 | 2 | 35-36 | AABU01002768 | 211000022280798 | 593945 | 542998 | CG40016 | 1743 | YES | ||
| KV0051 | 5 | 3 | 48 | (47-50) | AABU01002775 | 211000022280805 | 371002 | 69819 | CG17594 | -9600 | ||
| KV0114 | P | 3 | 47-50 | (47-50) | AABU01002775 | 211000022280805 | 371002 | 153713 | CG40001 | 28230 | ||
| KV0118 | P | 3 | 48-50 | (47-50) | AABU01002775 | 211000022280805 | 371002 | 174667 | CG40001 | 7276 | ||
| KV0369 | 9 | 2 | 42-43 | 2R.wgs3_cent | 354805 | |||||||
| KV0340 | 6 | Y | 15 | arm_2L | 2748009 | CG9894 | -2643 | YES | ||||
| KV0120 | P | 2 | 35 | (35) | arm_2L | 21662044 | CG1374 | -87 | ||||
| KV0143 | P | 2 | 37 | arm_2L | 22051303 | CG5922 | -3874 | |||||
| KV0015 | P | 2 | 35-36 | arm_2L | 22115759 | CG16937 | -19905 | |||||
| KV0042 | 5 | 2 | R telomere | arm_2R | 10677479 | CG30465 | -7391 | YES | ||||
| KV0017 | 1 | 3 | 57-58 | arm_3L | 17910625 | CG32193 | 274 | YES | ||||
| KV0349 | 6 | 3 | 47 | arm_3L | 22978940 | CG32458 | -30499 | YES | ||||
| KV0426 | 5 | 3 | L telomere | arm_3L | 22979012 | CG32458 | -30499 | YES | ||||
| KV0110 | P | 3 | 58 | arm_3R | 7369107 | CG14707 | -3927 | |||||
| KV0173 | P | 3 | R telomere | arm_3R | 27889981 | CG1483 | -5909 | |||||
| KV0050 | 5 | 3 | R telomere | arm_3R | 27890243 | CG1483 | -6712 | |||||
| KV0074 | 6 | 3 | 55-57 | arm_X | 1894440 | CG3724 | -1934 | YES | ||||
| KV0006 | 5 | X^Y | 1-2 | |||||||||
| KV0008 | 5 | |||||||||||
| KV0011 | P | 3 | 47 | homo lethal | ||||||||
| KV0022 | 5 | 3 | 48 | |||||||||
| KV0023 | 5 | Y | ||||||||||
| KV0024 | 5 | 3 | 47 | |||||||||
| KV0027 | 5 | 3 | 47 | |||||||||
| KV0030 | 5 | 3 | 48 | |||||||||
| KV0031 | 5 | 2 | 37 | |||||||||
| KV0032 | 5 | |||||||||||
| KV0033 | 5 | 2 | ||||||||||
| KV0034 | 5 | |||||||||||
| KV0035 | 5 | 3 | 49 | |||||||||
| KV0036 | 5 | X | 33-34 | |||||||||
| KV0037 | 5 | 3 | 50-52 | |||||||||
| KV0038 | 5 | 3 | 53 | |||||||||
| KV0040 | 5 | 3 | 56 | |||||||||
| KV0041 | 5 | 2 | 37 | |||||||||
| KV0043 | 5 | |||||||||||
| KV0044 | 5 | 2 | 38 | |||||||||
| KV0045 | 5 | 2 | 41 | |||||||||
| KV0046 | 5 | 2 | 36 | |||||||||
| KV0049 | 5 | 3 | 50-52 | |||||||||
| KV0054 | 5 | 2 | 35-36 | |||||||||
| KV0057 | 5 | |||||||||||
| KV0059 | 5 | 3 | 54 | |||||||||
| KV0061 | 5 | 3 | 47 | |||||||||
| KV0063 | 5 | |||||||||||
| KV0064 | 5 | |||||||||||
| KV0068 | 5 | 2 | 38 | |||||||||
| KV0071 | 5 | 2 | 35 | |||||||||
| KV0072 | 6 | 2 | 41 | |||||||||
| KV0081 | P | Y | 11-13 | |||||||||
| KV0082 | P | 2 & 3 | 35 & 47 | YES | ||||||||
| KV0093 | P | 2 | R arm | |||||||||
| KV0098 | P | 3 | 56 | |||||||||
| KV0101 | P | Y | 16 | |||||||||
| KV0102 | P | 3 | 48 | |||||||||
| KV0104 | P | 2 | 36-37 | |||||||||
| KV0107 | P | Y | 17-18 | |||||||||
| KV0108 | P | Y | 10 | |||||||||
| KV0111 | P | 2 | 46 | |||||||||
| KV0113 | P | Y | 22-24 | |||||||||
| KV0115 | P | 2 | 42-43 | |||||||||
| KV0116 | P | 2 | 35 | YES | ||||||||
| KV0117 | P | Y | 3 | |||||||||
| KV0125 | P | 2 | 38 | |||||||||
| KV0126 | P | 3 | 48 | |||||||||
| KV0128 | P | Y | 20 | |||||||||
| KV0137 | P | Y | 10 | |||||||||
| KV0140 | P | 2 | 39-41 | |||||||||
| KV0144 | P | 3 | L arm | |||||||||
| KV0145 | P | 2 | 39-41 | |||||||||
| KV0152 | P | 3 | 47-48 | |||||||||
| KV0153 | P | 3 | R telomere | |||||||||
| KV0156 | P | 3 | 47-48 | |||||||||
| KV0160 | P | 3 | 47 | |||||||||
| KV0161 | P | 2 | 42-43 | |||||||||
| KV0162 | P | 3 | 48-49 | |||||||||
| KV0163 | P | 3 | 48 | |||||||||
| KV0168 | P | Y | 10-14 | |||||||||
| KV0174 | P | Y | 21 | |||||||||
| KV0179 | 1 | |||||||||||
| KV0180 | 1 | 2 | 40-41 | |||||||||
| KV0181 | 1 | 2 | 38 | |||||||||
| KV0185 | 1 | |||||||||||
| KV0189 | 1 | |||||||||||
| KV0192 | 3 | Y | 14-15 | |||||||||
| KV0193 | 3 | Y | 18-19 | |||||||||
| KV0194 | 3 | |||||||||||
| KV0197 | 3 | Y | 14 | |||||||||
| KV0198 | 3 | |||||||||||
| KV0200 | 3 | |||||||||||
| KV0203 | 3 | |||||||||||
| KV0204 | 3 | |||||||||||
| KV0208 | 3 | |||||||||||
| KV0213 | 5 | |||||||||||
| KV0215 | 5 | |||||||||||
| KV0216 | 5 | |||||||||||
| KV0221 | 5 | |||||||||||
| KV0223 | 5 | |||||||||||
| KV0224 | 5 | |||||||||||
| KV0225 | 6 | 2 | 40-41 | |||||||||
| KV0226 | 8 | |||||||||||
| KV0229 | 1 | |||||||||||
| KV0230 | 1 | |||||||||||
| KV0231 | 1 | |||||||||||
| KV0232 | 7 | 2 | 43-44 | |||||||||
| KV0235 | 7 | |||||||||||
| KV0239 | 7 | Y | 3-4 | |||||||||
| KV0241 | 7 | |||||||||||
| KV0242 | 7 | |||||||||||
| KV0243 | 7 | |||||||||||
| KV0245 | 7 | |||||||||||
| KV0251 | 7 | 3 | 47-48 | |||||||||
| KV0257 | 7 | 2 | 38 | |||||||||
| KV0259 | 7 | 2 | 38-40 | |||||||||
| KV0275 | 9 | 2 | ||||||||||
| KV0276 | 9 | |||||||||||
| KV0279 | 3 | |||||||||||
| KV0281 | 5 | |||||||||||
| KV0282 | 9 | X^Y | 12-14 | |||||||||
| KV0283 | 9 | 2 | 37-38 | |||||||||
| KV0284 | 3 | |||||||||||
| KV0285 | 3 | Y | ||||||||||
| KV0286 | 3 | Y | ||||||||||
| KV0287 | 5 | |||||||||||
| KV0290 | 5 | |||||||||||
| KV0291 | 6 | 2 | 38-39 | |||||||||
| KV0292 | 5 | Y | ||||||||||
| KV0293 | 6 | |||||||||||
| KV0296 | 5 | |||||||||||
| KV0297 | 1 | Y | ||||||||||
| KV0298 | 6 | 2 | 40 | |||||||||
| KV0300 | 5 | |||||||||||
| KV0301 | 3 | |||||||||||
| KV0306 | 5 | |||||||||||
| KV0307 | 5 | X^Y | ||||||||||
| KV0309 | 6 | 2 | 46 | |||||||||
| KV0310 | 6 | 2 | 42 |